胡锦涛同志在全国科技创新大会上的重要讲话指出，当今世界，科技创新更加广泛地影响着经济社会发展和人民生活，科技发展水平更加深刻地反映出一个国家的综合国力和核心竞争力。我们要推进改革开放和社会主义现代化，实现全面建设小康社会目标，不断提高人民生活水平，实现中华民族伟大复兴，必须从国家发展全局的高度，集中精力推进科技创新。贯彻落实这一重要讲话精神，需要我们深化科技体制改革，提高科技创新效能。
　　改革开放30多年来，我国经济社会发展取得了举世瞩目的巨大成就，其中科技的作用功不可没。目前，我国发展已进入工业化中后期阶段，劳动、资本投入边际收益递减现象越来越明显，经济发展的主要动力正转为科技和制度创新。特别是在发达地区，土地、资源、环境制约更为严重，劳动力成本上升更为突出，加快转变经济发展方式、实现创新驱动发展的要求越来越紧迫。加快转变经济发展方式，实现创新驱动发展，最根本的是要靠科技的力量，最关键的是要大幅提高自主创新能力。
　　应当看到，目前我国科技体制机制与经济社会发展和国际竞争的要求还不相适应，影响科技投入的产出效益，制约科学技术第一生产力作用的发挥。其主要表现，一是科技资源分散，规模效应不明显。分散在各个领域的科技资源由于条块分割，导致短缺与闲置现象并存；由于统筹不够，造成重复投入。二是科技创新主体内生动力不强，创新效能较低。由于科技管理体制和评价机制导向性不强，科技创新主体缺乏足够的创新动力，尤其是对科技项目的实际转化关注不够，满足于立项和结项，进而导致创新效能较低。三是企业的创新主体地位不突出，存在科技和经济“两张皮”现象。以企业为主体、以市场为导向、产学研结合的技术创新体系还没有真正建立起来，企业在科技资源配置中的发言权有限，在科技活动中的作用不明显。解决这些问题，提高科技创新效能，需要在以下方面努力。
　　充分发挥企业在创新中的主体作用。充分吸收企业参与科研项目的立项、研发及成果应用，建立由企业牵头、以应用为目标的科技项目协同攻关机制。进一步完善项目基金制、招标制和技术合同制，推动科研市场发展。在科技和经济政策上给科技型中小企业以更大支持，发挥它们在技术创新和成果转化中的独特作用。同时，重视创新型企业家队伍建设，着力完善企业家创业创新、培养和成长机制。
　　健全和完善科技绩效评价体系和评估制度。加快建立符合科技创新活动特质的量化考核指标体系，既考核科技项目的经济效益，又考核科技管理部门、科技资源拥有和支配部门的创新效益，并实行相关科技政策实施绩效评估制度。进一步加大知识产权保护力度，促进产学研紧密协作、优势互补，尤其是在关键性技术上鼓励企业与科研院所共同出资、共担风险、共享成果，实现创新效益最大化。
　　提升科技资源的配置效率，推动协同创新。深化科技管理体制改革，在各管理部门和职能部门之间建立决策协调机制，完善重大决策评议制度，建立跨部门的第三方评估机制，强化绩效评估和监督，努力形成协同创新新格局。加快建立科研设施和科技信息社会共享机制，建立科技报告制度，尽量公开科研活动过程及成果。加快建设开放的科技资源市场化共享合作平台，推动政府投资建设的科研设施以非营利方式向社会开放，鼓励高等院校、科研院所及企业的科研设施以合理收费等方式向社会开放，促进科技资源共享。