我国医保付费长期以来是按服务项目付费，被视为“浪费型医疗”制度的根源，随着基本医疗保险制度、基本药物制度、基本医疗卫生服务体系等建设完成，医保支付方式改革将成为撬动下一阶段医疗体制改革的钥匙。
　　老龄化社会到来与医保覆盖面扩大是“十二五”医改的重要背景，虽然我国经济发展开始减速，但医药费用刚刚进入快速增长通道。在人力资源与社会保障部专家看来，未来几年医保付费应该由数量向质量提升，但医保付费面临的重大问题仍是“差钱”，如何在付费方式改革过程中寻得各方利益诉求的平衡，是“十二五”医改面临的难题之一。
　　首先，支付方式改革对公立医院将形成压力。卫生部部长陈竺表示，用总额预付、按病种、按服务单元、按人头等预付方式取代按项目的后付方式，支付制度改革与取消以药补医相辅相成。从这个角度而言，支付方式改革将打破“以药养医”的利益格局。医院无法再靠多提供治疗获取经济效益。
　　但业内人士担忧，总额预付等虽然可以设定医保支付上限，却无法撬动大医院在诊疗过程中的主动权，在药品收入占医院总收入达40%的背景下，医保控费与公立医院的博弈，或会导致医疗服务质量的下降。
　　其次，医保支付方式改革呼唤对医疗服务和病种诊疗的市场化定价。在公立医院为主的体系中，医疗服务价格既不充分代表市场需求，也不能完全体现医务人员劳动价值。在此基础上扩大按病种付费的试点，将考验医疗资源配置的均衡性。如何在不增加群众负担、不过分消耗社会福利的同时，又保证医务人员的积极性，将考验支付方式改革过程中的资源配置。
　　第三，各地经济社会发展状况不一致，支付方式改革的区域规划也将趋向多元。以按人头付费为例，因各地试点进度不同，形成超过7种按人头付费方式，不同级别医院中的按人头付费也存有差异。此外，总额预付、按病种付费和按人头付费等互补出现，也对付费方式改革的推广和控费措施的制定形成考验。
　　破除“以药养医”被视为“十二五”期间医改工作的重要课题，但“药不养医，谁来养医？”的问题会与支付方式改革并肩出现，因而，增加政府投入、扩大社会资本办医、完善医生绩效考核机制、建立激励分配机制等解决方式，都成为业界专家探索的重点。
　　在上述因素制约下，政府如何有效配置医保资源、完善多渠道补偿机制并缩小基层医疗卫生机构的收支缺口，将影响支付方式改革的成效。目前，《医改“十二五”规划》即将出台，关于支付方式改革的讨论正在升温，而改革的重点将集中在医保控费和降低药品过多使用方面，预计对医药行业增长将构成进一步压力。