日本特大地震导致的核扩散威胁取代了地震和海啸，成为全球关注的焦点。这也成为评估今后日本经济损失的决定因素。
此前，由于对日本福岛核电站的受损情况不太了解，人们判断本次特大地震和海啸所造成的各种损失仍基于自然灾害的一般常识，正如日本内阁官房长官枝野幸男所言，日本的经济基础并未受到破坏，技术基础还在。其言外之意是，日本经济没有太大的问题。但随着核电站形势日趋恶化，对于核扩散的恐慌正在全日本蔓延。日本经济能否向阪神大地震一样，用6个月左右的时间恢复过来，这个疑问越来越大。
这次巨大地震造成了多少损失，至今情况不明，据美国高盛公司15日发表的报告认为，东日本巨大地震灾害造成的损失额将达16万亿日元，远远超过阪神大地震(当年阪神大地震造成的损失为10万亿日元)，并认为第二季度日本GDP因此会出现负增长，2011年日本实际GDP增长会因地震减少0.5个百分点。
遭受这么大的损失，重建费用从哪里来，只能发行国债，日本媒体报道说，政府有关人士透露，至少通过补充预算要筹集10万亿日元的款项，而补充预算的钱在目前税收减少的情况下只能靠发行国债解决。日本国家债务已经超过GDP的200%，在发达国家中最差，再发行巨额国债无疑进一步恶化财政状况，更加影响日本在国际市场的信用，从长期来看，对日本经济极为不利。
值得一提的是，轮流停电计划导致铁路减少车次和商店缩短营业时间、物流混乱，汽油不足、因辐射污染各国对日本农产品失去信任，灾区农业生产恢复需要时间等，都会给日本经济带来实实在在的影响。日本的经济和生活秩序何时能够恢复，现在很难预料，这种混乱在某种程度上会从根本上遏制日本经济复苏的势头。
日本福岛第一核电站事故对日本发展核电、官民并举向国外推介核电设施，把核电作为经济增长点的既定国策也将产生重大影响。
修建核电站不仅要考虑能抗巨大地震，还要考虑到巨大海啸，如何加强安全管理也是迫在眉睫的问题，这些问题都摆在日本决策者面前。同时，人们对日本的核设施的安全也产生了疑问，日本发展核电的既定国策有可能会因此调整，日本的核设施出口也可能大打折扣，核电能否成为日本经济的新增长点，现在看来是一个问号。
总之，东日本巨大地震对日本经济的影响是长期的、巨大的，日本的核技术也已露出了破绽，日本要渡过这一难关需要很长一段时间。