针对石漠化治理面临的资金短缺、科技支撑不够等诸多难题，一些石漠化研究专家和基层干部建议，国家和地方政府应加大对石漠化治理的政策和资金支持力度，构建区域、部门协作机制，形成合力，集中资金，强化石漠化治理的科技支撑，力争治理一片成功一片，从根本上遏制石漠化扩张势头。
　　贵州师范大学中国南方喀斯特研究院院长熊康宁在接受《经济参考报》记者采访时表示，石漠化的基本特征是生态环境脆弱、水土流失严重、地表水匮乏，不同等级的石漠化，环境退化程度存在差别。因此，不同等级的石漠化生态系统重建，都需要有一定的科技支撑，尤其是石漠化治理的一些基础理论、工程技术、综合治理模式、管理模式、生态产业化与综合效益评价指标体系等。
　　熊康宁指出，目前，针对石漠化治理的国家技术、投资标准基本“空白”，石漠化治理的科技研究远远滞后于项目治理。
　　中国科学院地球化学研究所副所长王世杰表示，西南石漠化地区往往人口数量大、密度高，政府考虑自然恢复或环境移民难度大，要治理石漠化，必须与自然生态模式相适应，否则效果不可持续。他认为，现在很多的石漠化治理模式都是基层自发探索，缺乏科学依据，在治理之前对地质环境、形成机理等没有充分认识，治理成了笔“糊涂账”。
　　同时，有专家建议，从省级层面组建区域发展协作机构，涉及的地州市全部参与，建立工作联系机制，设立联络机构和人员，加强信息交流和工作配合力度，加强彼此间的沟通和协作。
　　云南文山壮族苗族自治州农业局调研员王本忠建议，国家应扶持贫困山区建高标准农田，提高农业产业化水平。目前，大部分石漠化地区的农业产业化发展程度较低，农民增收渠道单一，一定程度上增加了石漠化治理的难度。目前云南文山壮族苗族自治州有774万亩耕地进入国家耕地保护面积，但坡度在19度到25度的耕地就占了1/3，由于跑水、跑土、跑肥，能做到旱涝保收的很少，因而要对这些耕地进行综合整治。在此基础上，培育一些农业产业项目，促进农民增收。